海参的染色体水平基因组组装揭示了其居维叶器官的细节

隶属于中国多个机构的海洋、分子和遗传生物学家组成的大型团队对黑海参(Holothuria leucospilota)进行了他们所谓的高质量染色体水平基因组组装。在这样做的过程中，他们更多地了解了它的居维亚器官。

在他们发表在《美国国家科学院院刊》上的论文中，该小组描述了他们如何研究海洋生物的基因组和居维叶器官制造的蛋白质，以及他们从中学到的东西。

黑海参是一种海洋无脊椎动物。顾名思义，它看起来有点像黑黄瓜。它生活在印太地区，靠吃沉入海底的有机物生存。但使黄瓜与大多数其他生物不同的是它的居维亚器官 - 一团看起来像白色绳子的纤维。

黄瓜在受到捕食者的干扰时将器官从体内弹出，然后长出一个新的器官。琴弦的粘性可防止捕食者攻击。只有在仔细检查居维亚器官后，它才被确定为一个器官，而不仅仅是一团粘性蛋白质。

人们还注意到，独特的防御机制已被证明非常有效，以至于黑海参被称为优势物种。在这项新的努力中，中国的团队试图更多地了解这个器官，以更好地了解这种生物是如何变得如此占主导地位的。

为了了解更多信息，研究小组分析了海洋生物的基因组，特别关注与其居维叶器官相关的基因。然后，他们使用一个名为AlphaFold的计算机程序来预测哪些蛋白质会被他们发现的不同基因编码。在这样做的过程中，研究小组惊讶地发现，一些蛋白质是其他生物受体细胞上常见的那种蛋白质。

他们还发现，器官的线条外观不是由于氨基酸序列造成的，例如在蜘蛛线中发现的氨基酸序列。相反，这是由于长链蛋白质。研究小组还发现，这种粘性是由于性质类似于淀粉样蛋白的蛋白质。